Znanstvena djelatnost na Stomatološkom fakultetu se iskazuje:

• znanstvenoistraživačkim projektima (popis projekata) i programima (popis programa)
• znanstvenim radovima u časopisima (u međunarodnim indeksnim publikacijama)
• izradi doktorskih radova
• studentskim znanstvenim aktivnostima

U području znanstvene djelatnosti djeluju tri radna tijela:

• Odbor za znanost
• Odbor za poslijediplomske studije-doktorski studij
• Povjerenstvo za uvođenje studenata u znanstveni rad

Glavna odgovorna osoba koja potiče, koordinira i usmjerava sve oblike znanstvene djelatnosti je prodekan za znanost, prof.dr.sc. Silvana Jukić Krmek.